Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOL3O95236 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOL3O95236 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOL3O95236 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOL3O95236 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOL3O95236 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOL3O95236 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOL3O95236 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOL3O95236 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOL3O95236 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOL3O95236 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOL3O95236 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
APOL3O95236 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOL3O95236 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APOL3O95236 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOL3O95236 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOL3O95236 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOL3O95236 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOL3O95236 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOL3O95236 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOL3O95236 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOL3O95236 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOL3O95236 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOL3O95236 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOL3O95236 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOL3O95236 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms