Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms