Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms