Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1Q9Y3T6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms