Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

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Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
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