Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms