Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms