Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms