Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ8

KRTAP4-9, Keratin-associated protein 4-9, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC084082.1-202ENST00000517961 956 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 OR7E2P-201ENST00000533071 889 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AP4S1-206ENST00000554609 1012 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 ADAL-204ENST00000562188 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC010542.2-201ENST00000568560 511 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 LINC00629-202ENST00000592070 844 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL445223.1-201ENST00000595998 1051 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 TTC8-204ENST00000354441 1342 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC026765.2-201ENST00000551875 1330 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 CTXN3-202ENST00000395322 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 GLRX-201ENST00000237858 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 ZNF254-201ENST00000339642 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 LHX9-202ENST00000367388 758 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 RLN2-201ENST00000381627 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL161725.1-203ENST00000415004 1081 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL591686.1-201ENST00000421878 766 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 LINC00114-202ENST00000429621 827 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 LINC01803-201ENST00000438659 613 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 MIR100HG-211ENST00000531071 970 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL136418.1-201ENST00000551799 975 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 LINC01579-206ENST00000556928 657 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC012158.1-203ENST00000488306 1352 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP4-9Q9BYQ8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms