RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CTXN3-202ENST00000395322 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.32■■□□□ 1.96
CTXN3-202ENST00000395322 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.72■■□□□ 1.55
CTXN3-202ENST00000395322 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CTXN3-202ENST00000395322 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CTXN3-202ENST00000395322 FOXD1Q16676 465 aa22.7■■□□□ 1.22
CTXN3-202ENST00000395322 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.9■■□□□ 1.1
CTXN3-202ENST00000395322 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.59■■□□□ 1.05
CTXN3-202ENST00000395322 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.3■■□□□ 1
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CTXN3-202ENST00000395322 ADRA2BP18089 450 aa21.25■□□□□ 0.99
CTXN3-202ENST00000395322 MSH5O43196 834 aa21.24■□□□□ 0.99
CTXN3-202ENST00000395322 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
CTXN3-202ENST00000395322 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa20.51■□□□□ 0.87
CTXN3-202ENST00000395322 POTEDQ86YR6 584 aa20.46■□□□□ 0.87
CTXN3-202ENST00000395322 DCAF8L2P0C7V8 631 aa20.24■□□□□ 0.83
CTXN3-202ENST00000395322 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.2■□□□□ 0.82
CTXN3-202ENST00000395322 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.2■□□□□ 0.82
CTXN3-202ENST00000395322 ABCC9O60706 1549 aa20.05■□□□□ 0.8
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CTXN3-202ENST00000395322 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.79■□□□□ 0.76
CTXN3-202ENST00000395322 SCRIBQ14160 1630 aa19.77■□□□□ 0.76
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CTXN3-202ENST00000395322 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
CTXN3-202ENST00000395322 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
CTXN3-202ENST00000395322 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.4■□□□□ 0.7
CTXN3-202ENST00000395322 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.38■□□□□ 0.69
CTXN3-202ENST00000395322 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
CTXN3-202ENST00000395322 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa19.18■□□□□ 0.66
CTXN3-202ENST00000395322 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
CTXN3-202ENST00000395322 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.11■□□□□ 0.65
CTXN3-202ENST00000395322 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.1■□□□□ 0.65
CTXN3-202ENST00000395322 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.06■□□□□ 0.64
CTXN3-202ENST00000395322 SMARCA4P51532 1647 aa19■□□□□ 0.63
CTXN3-202ENST00000395322 WIZO95785 1651 aa18.96■□□□□ 0.63
CTXN3-202ENST00000395322 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.88■□□□□ 0.61
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CTXN3-202ENST00000395322 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
CTXN3-202ENST00000395322 SMARCA2P51531 1590 aa18.66■□□□□ 0.58
CTXN3-202ENST00000395322 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
CTXN3-202ENST00000395322 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa18.58■□□□□ 0.56
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CTXN3-202ENST00000395322 CCDC88BA6NC98 1476 aa18.55■□□□□ 0.56
CTXN3-202ENST00000395322 DCAF8L1A6NGE4 600 aa18.53■□□□□ 0.56
CTXN3-202ENST00000395322 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
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CTXN3-202ENST00000395322 HMGXB3Q12766 1538 aa18.47■□□□□ 0.55
CTXN3-202ENST00000395322 TRIM41Q8WV44 630 aa18.42■□□□□ 0.54
CTXN3-202ENST00000395322 NCAPD3P42695 1498 aa18.4■□□□□ 0.54
CTXN3-202ENST00000395322 ABCC8Q09428 1581 aa18.24■□□□□ 0.51
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CTXN3-202ENST00000395322 RNF39Q9H2S5 420 aa18.12■□□□□ 0.49
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CTXN3-202ENST00000395322 CFTRP13569 1480 aa18.05■□□□□ 0.48
CTXN3-202ENST00000395322 EEA1Q15075 1411 aa18.04■□□□□ 0.48
CTXN3-202ENST00000395322 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.04■□□□□ 0.48
CTXN3-202ENST00000395322 SYNJ1O43426 1573 aa18.04■□□□□ 0.48
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CTXN3-202ENST00000395322 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18■□□□□ 0.47
CTXN3-202ENST00000395322 TOP2BQ02880 1626 aa17.99■□□□□ 0.47
CTXN3-202ENST00000395322 KCNA4P22459 653 aa17.99■□□□□ 0.47
CTXN3-202ENST00000395322 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.92■□□□□ 0.46
CTXN3-202ENST00000395322 SOGA1O94964 1423 aa17.89■□□□□ 0.45
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CTXN3-202ENST00000395322 CUX1P39880 1505 aa17.83■□□□□ 0.44
CTXN3-202ENST00000395322 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.82■□□□□ 0.44
CTXN3-202ENST00000395322 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.81■□□□□ 0.44
CTXN3-202ENST00000395322 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.81■□□□□ 0.44
CTXN3-202ENST00000395322 KIF21BO75037 1637 aa17.8■□□□□ 0.44
CTXN3-202ENST00000395322 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.79■□□□□ 0.44
CTXN3-202ENST00000395322 GOLGA3Q08378 1498 aa17.78■□□□□ 0.44
CTXN3-202ENST00000395322 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.76■□□□□ 0.43
CTXN3-202ENST00000395322 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.75■□□□□ 0.43
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CTXN3-202ENST00000395322 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.7■□□□□ 0.42
CTXN3-202ENST00000395322 DNMBPQ6XZF7 1577 aa17.68■□□□□ 0.42
CTXN3-202ENST00000395322 KIF27Q86VH2 1401 aa17.66■□□□□ 0.42
CTXN3-202ENST00000395322 NESP48681 1621 aa17.65■□□□□ 0.42
CTXN3-202ENST00000395322 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.64■□□□□ 0.41
CTXN3-202ENST00000395322 CEP162Q5TB80 1403 aa17.63■□□□□ 0.41
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CTXN3-202ENST00000395322 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.62■□□□□ 0.41
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CTXN3-202ENST00000395322 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.55■□□□□ 0.4
CTXN3-202ENST00000395322 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa17.55■□□□□ 0.4
CTXN3-202ENST00000395322 CUX2O14529 1486 aa17.54■□□□□ 0.4
CTXN3-202ENST00000395322 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
CTXN3-202ENST00000395322 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
CTXN3-202ENST00000395322 PCGF6Q9BYE7 350 aa17.5■□□□□ 0.39
CTXN3-202ENST00000395322 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.49■□□□□ 0.39
CTXN3-202ENST00000395322 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
CTXN3-202ENST00000395322 WDR97A6NE52 1622 aa17.48■□□□□ 0.39
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