Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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