Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARXQ96QS3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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