Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms