Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMD3Q96D46 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMD3Q96D46 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms