Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC112Q8NEF3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms