Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROM2Q8N271 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms