Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms