Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms