Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.087e-7■■■■■ 35.6
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PRPF8Q6P2Q9 CD58-204ENST00000464088 874 ntTSL 1 (best)17.69■□□□□ 0.427e-18■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.392e-9■■■■■ 35.4
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