Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms