Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms