Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q56UQ5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q56UQ5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms