Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFX4Q33E94 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFX4Q33E94 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms