Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms