Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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