Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms