Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP10Q15642 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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