Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
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TRAF3Q13114 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TRAF3Q13114 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TRAF3Q13114 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TRAF3Q13114 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TRAF3Q13114 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TRAF3Q13114 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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TRAF3Q13114 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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TRAF3Q13114 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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TRAF3Q13114 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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TRAF3Q13114 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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TRAF3Q13114 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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