Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms