Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBSQ01459 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBSQ01459 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms