Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms