Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNB1P98172 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms