Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RPS28P62857 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS28P62857 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS28P62857 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS28P62857 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS28P62857 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS28P62857 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS28P62857 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS28P62857 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS28P62857 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS28P62857 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS28P62857 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms