Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZEB1P37275 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms