Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH1P12830 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH1P12830 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH1P12830 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH1P12830 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH1P12830 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH1P12830 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH1P12830 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH1P12830 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH1P12830 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDH1P12830 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH1P12830 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH1P12830 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH1P12830 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH1P12830 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH1P12830 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH1P12830 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH1P12830 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH1P12830 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH1P12830 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH1P12830 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH1P12830 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH1P12830 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH1P12830 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH1P12830 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH1P12830 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH1P12830 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH1P12830 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH1P12830 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDH1P12830 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDH1P12830 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH1P12830 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH1P12830 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH1P12830 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH1P12830 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH1P12830 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH1P12830 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH1P12830 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH1P12830 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH1P12830 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH1P12830 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH1P12830 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH1P12830 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH1P12830 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH1P12830 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDH1P12830 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms