Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOA1P02647 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOA1P02647 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA1P02647 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA1P02647 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA1P02647 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms