Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLIN1O60240 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLIN1O60240 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms