Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASKO14936 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASKO14936 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASKO14936 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASKO14936 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASKO14936 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASKO14936 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASKO14936 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CASKO14936 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASKO14936 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASKO14936 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASKO14936 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms