Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms