Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms