Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QQQ9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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J3QQQ9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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J3QQQ9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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J3QQQ9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QQQ9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
J3QQQ9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
J3QQQ9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
J3QQQ9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
J3QQQ9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
J3QQQ9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QQQ9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QQQ9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QQQ9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QQQ9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QQQ9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QQQ9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QQQ9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QQQ9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QQQ9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QQQ9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QQQ9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QQQ9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QQQ9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QQQ9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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