Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359736.3-201ENST00000626707 303 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 IPO7-208ENST00000630083 195 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6511B2-201ENST00000636908 71 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NNT-AS1-204ENST00000513560 4769 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01016-201ENST00000506222 3151 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 OR9I1-202ENST00000641439 3184 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF608-203ENST00000504926 4726 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AP004782.1-201ENST00000623990 3433 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ARSF-202ENST00000381127 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC135012.1-201ENST00000563931 7430 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ARMC3-204ENST00000409983 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FGD5P1-201ENST00000611158 3374 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ERI2-208ENST00000564349 3657 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ITPRIPL1-201ENST00000361124 4295 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR9-3HG-203ENST00000546186 2718 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AF254983.1-201ENST00000612267 3336 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL32-205ENST00000539200 3600 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC129-201ENST00000319386 4544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 EFNB2-201ENST00000245323 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PTAFR-202ENST00000373857 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092902.5-201ENST00000641650 3256 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MTO1-201ENST00000370300 2961 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CD164-203ENST00000324953 2936 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RALBP1-201ENST00000019317 4368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MCTP1-202ENST00000429576 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CTBP2-203ENST00000337195 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CLN8-201ENST00000331222 7169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF6-203ENST00000381588 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 UNKL-210ENST00000508903 3430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RABL2A-207ENST00000409875 2282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF18BP1-201ENST00000567585 2264 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP83-201ENST00000339839 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1E-201ENST00000357570 7064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1E-206ENST00000367573 7067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CCT5-201ENST00000280326 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TAF1C-201ENST00000341690 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GIMAP8-201ENST00000307271 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PPFIA2-204ENST00000541017 4192 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms