Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8H2

KRTAP5-3, Keratin-associated protein 5-3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP5-3Q6L8H2 PIGN-202ENST00000400334 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 XIRP1-202ENST00000396251 6040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PRDM1-201ENST00000369089 4675 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF23-201ENST00000357254 3186 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 USP32P1-201ENST00000341745 3233 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 EFTUD2-223ENST00000592576 3364 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AC068491.4-201ENST00000622940 3380 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SALL1-201ENST00000251020 5146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 NLRC3-201ENST00000324659 3414 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF835-201ENST00000537055 3450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AC011899.1-201ENST00000436489 3600 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AC135048.4-201ENST00000624286 3641 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 KDM2A-201ENST00000308783 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC12A4-219ENST00000576616 3768 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SERAC1-202ENST00000367104 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MCFD2-207ENST00000409913 3975 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 RNF141-201ENST00000265981 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 P4HA2-203ENST00000379086 2223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 DDX24-202ENST00000544005 2214 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 HSPA8-218ENST00000532636 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 NPC1L1-201ENST00000289547 5048 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ASH2L-202ENST00000428278 2678 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AC092132.2-201ENST00000611227 2744 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 NOP2-223ENST00000620535 2791 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 COG2-201ENST00000366668 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 NVL-203ENST00000391875 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 GFM2-202ENST00000345239 2856 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TMBIM1-214ENST00000444881 2936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MRPL22-201ENST00000265229 3035 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AF067845.2-201ENST00000617093 3049 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 STAT2-210ENST00000557235 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 OR9M1P-202ENST00000641564 3163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 GABRP-201ENST00000265294 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AC011199.1-201ENST00000625022 3362 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 FIGNL1-211ENST00000611938 3543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 HK1-202ENST00000359426 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TRMO-207ENST00000611338 3635 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CSPG4P4Y-201ENST00000333235 3724 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CSPG4P3Y-201ENST00000418188 3724 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 FRMPD1-202ENST00000377765 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 XYLB-201ENST00000207870 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF702P-201ENST00000270443 2990 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SERINC4-202ENST00000319327 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246.6 ms