Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POMPQ9Y244 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POMPQ9Y244 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POMPQ9Y244 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POMPQ9Y244 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POMPQ9Y244 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POMPQ9Y244 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POMPQ9Y244 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POMPQ9Y244 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POMPQ9Y244 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POMPQ9Y244 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POMPQ9Y244 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POMPQ9Y244 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POMPQ9Y244 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POMPQ9Y244 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POMPQ9Y244 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POMPQ9Y244 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POMPQ9Y244 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POMPQ9Y244 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms