Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms