Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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RABGEF1Q9UJ41 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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RABGEF1Q9UJ41 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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RABGEF1Q9UJ41 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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RABGEF1Q9UJ41 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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RABGEF1Q9UJ41 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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RABGEF1Q9UJ41 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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