Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms