Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms