Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms