Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 325.9 ms